O botão de cima para o polegar tem por definição o número 8, é necessário configurar a emulação para esse botão e activá-la:
xinput set-int-prop "Logitech USB Receiver" "Wheel Emulation" 16 1
xinput set-int-prop "Logitech USB Receiver" "Wheel Emulation Button" 16 8
O xinput e o xrandr precisam de um GUI à maneira… 🙂
UPDATE: No Jaunty os nomes dos props mudaram:
xinput set-int-prop "Logitech USB Receiver" "Evdev Wheel Emulation" 8 1
xinput set-int-prop "Logitech USB Receiver" "Evdev Wheel Emulation Button" 8 8